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Text File  |  1995-03-04  |  1.8 KB  |  39 lines
  1. ******************************************************
  2. * Fructose-bisphosphate aldolase class-II signatures *
  3. ******************************************************
  4.  
  5. Fructose-bisphosphate aldolase (EC 4.1.2.13) [1,2] is a glycolytic enzyme that
  6. catalyzes  the reversible  aldol cleavage   or  condensation of  fructose-1,6-
  7. bisphosphate into  dihydroxyacetone-phosphate and  glyceraldehyde 3-phosphate.
  8. There are  two  classes  of  fructose-bisphosphate  aldolases  with  different
  9. catalytic mechanisms.  Class-II aldolases [2], mainly found in prokaryotes and
  10. fungi, are homodimeric enzymes which  require a divalent metal ion - generally
  11. zinc - for their activity.
  12.  
  13. As signature  patterns for  this class  of  enzyme, we  selected two conserved
  14. regions. The first  pattern is  located in the  first half of the sequence and
  15. contains two  histidine  residues  that  have been shown [4] to be involved in
  16. binding a  zinc  ion.  The  second  is  located  in the C-terminal section and
  17. contains two clustered acidic residues.
  18.  
  19. -Consensus pattern: [FY]-x(1,3)-[LIVM]-x-[LIVM]-x-[LIVM]-H-x-D-H-[GC]
  20.                     [The two H's are zinc ligands]
  21. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  22. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  23.  
  24. -Consensus pattern: [LIVMF]-x(2)-[GSA]-[LIVM]-x(2)-G-x(2)-K-[LIVM]-N-[LIVM]-
  25.                     [DN]-T-[DE]
  26. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  27. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  28.  
  29. -Last update: June 1994 / Patterns and text revised.
  30.  
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